Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELAQ04206 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELAQ04206 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELAQ04206 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELAQ04206 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELAQ04206 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELAQ04206 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELAQ04206 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELAQ04206 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELAQ04206 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELAQ04206 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELAQ04206 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELAQ04206 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELAQ04206 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELAQ04206 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RELAQ04206 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELAQ04206 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELAQ04206 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELAQ04206 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELAQ04206 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELAQ04206 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELAQ04206 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELAQ04206 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RELAQ04206 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELAQ04206 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELAQ04206 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELAQ04206 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RELAQ04206 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELAQ04206 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELAQ04206 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELAQ04206 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELAQ04206 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms