Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms