Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms