Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms