Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRA2BP62995 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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