Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPD2P62316 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms