Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms