Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSX2P58304 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSX2P58304 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSX2P58304 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSX2P58304 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms