Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP4P57796 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP4P57796 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP4P57796 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP4P57796 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP4P57796 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP4P57796 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP4P57796 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP4P57796 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP4P57796 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP4P57796 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP4P57796 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP4P57796 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP4P57796 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP4P57796 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP4P57796 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP4P57796 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP4P57796 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP4P57796 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP4P57796 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP4P57796 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP4P57796 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP4P57796 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABP4P57796 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABP4P57796 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABP4P57796 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABP4P57796 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABP4P57796 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CABP4P57796 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABP4P57796 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABP4P57796 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABP4P57796 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABP4P57796 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABP4P57796 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CABP4P57796 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABP4P57796 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABP4P57796 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CABP4P57796 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CABP4P57796 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABP4P57796 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABP4P57796 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABP4P57796 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABP4P57796 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABP4P57796 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABP4P57796 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABP4P57796 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABP4P57796 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABP4P57796 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABP4P57796 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABP4P57796 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABP4P57796 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABP4P57796 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABP4P57796 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CABP4P57796 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABP4P57796 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABP4P57796 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABP4P57796 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABP4P57796 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABP4P57796 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABP4P57796 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABP4P57796 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABP4P57796 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CABP4P57796 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CABP4P57796 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CABP4P57796 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABP4P57796 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABP4P57796 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABP4P57796 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABP4P57796 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABP4P57796 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABP4P57796 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABP4P57796 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABP4P57796 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CABP4P57796 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CABP4P57796 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CABP4P57796 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CABP4P57796 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CABP4P57796 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CABP4P57796 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CABP4P57796 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CABP4P57796 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CABP4P57796 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CABP4P57796 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CABP4P57796 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CABP4P57796 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CABP4P57796 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CABP4P57796 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CABP4P57796 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CABP4P57796 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CABP4P57796 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CABP4P57796 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CABP4P57796 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CABP4P57796 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CABP4P57796 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CABP4P57796 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CABP4P57796 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CABP4P57796 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CABP4P57796 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CABP4P57796 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CABP4P57796 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms