Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP107P57740 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP107P57740 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP107P57740 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP107P57740 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP107P57740 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP107P57740 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP107P57740 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP107P57740 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP107P57740 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP107P57740 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP107P57740 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP107P57740 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP107P57740 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP107P57740 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP107P57740 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP107P57740 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP107P57740 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP107P57740 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP107P57740 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP107P57740 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP107P57740 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP107P57740 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP107P57740 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP107P57740 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP107P57740 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP107P57740 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms