Protein–RNA interactions for Protein: P56381

ATP5E, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5EP56381 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ATP5EP56381 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms