Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GFRA1P56159 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA1P56159 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GFRA1P56159 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GFRA1P56159 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GFRA1P56159 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GFRA1P56159 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GFRA1P56159 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GFRA1P56159 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GFRA1P56159 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GFRA1P56159 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GFRA1P56159 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GFRA1P56159 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GFRA1P56159 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GFRA1P56159 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms