Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP9P55211 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP9P55211 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP9P55211 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CASP9P55211 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms