Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms