Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR4P51679 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR4P51679 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCR4P51679 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCR4P51679 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCR4P51679 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCR4P51679 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCR4P51679 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCR4P51679 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCR4P51679 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms