Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR4P51571 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSR4P51571 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR4P51571 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms