Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms