Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLK1P49759 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLK1P49759 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLK1P49759 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLK1P49759 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLK1P49759 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLK1P49759 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLK1P49759 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLK1P49759 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLK1P49759 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLK1P49759 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLK1P49759 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLK1P49759 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLK1P49759 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLK1P49759 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLK1P49759 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLK1P49759 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLK1P49759 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLK1P49759 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLK1P49759 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLK1P49759 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLK1P49759 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLK1P49759 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLK1P49759 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLK1P49759 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLK1P49759 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLK1P49759 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLK1P49759 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLK1P49759 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLK1P49759 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLK1P49759 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLK1P49759 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLK1P49759 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLK1P49759 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLK1P49759 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLK1P49759 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLK1P49759 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLK1P49759 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLK1P49759 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLK1P49759 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLK1P49759 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLK1P49759 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLK1P49759 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLK1P49759 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLK1P49759 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLK1P49759 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLK1P49759 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLK1P49759 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLK1P49759 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLK1P49759 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLK1P49759 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLK1P49759 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLK1P49759 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLK1P49759 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLK1P49759 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLK1P49759 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLK1P49759 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLK1P49759 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLK1P49759 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms