Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ME1P48163 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ME1P48163 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ME1P48163 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ME1P48163 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ME1P48163 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ME1P48163 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ME1P48163 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ME1P48163 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ME1P48163 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ME1P48163 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ME1P48163 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ME1P48163 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ME1P48163 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ME1P48163 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ME1P48163 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ME1P48163 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ME1P48163 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ME1P48163 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ME1P48163 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ME1P48163 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ME1P48163 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ME1P48163 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ME1P48163 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ME1P48163 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ME1P48163 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ME1P48163 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ME1P48163 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ME1P48163 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ME1P48163 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ME1P48163 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ME1P48163 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ME1P48163 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ME1P48163 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ME1P48163 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ME1P48163 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ME1P48163 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ME1P48163 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ME1P48163 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ME1P48163 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ME1P48163 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ME1P48163 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ME1P48163 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ME1P48163 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ME1P48163 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ME1P48163 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ME1P48163 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ME1P48163 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ME1P48163 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ME1P48163 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ME1P48163 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ME1P48163 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ME1P48163 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ME1P48163 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ME1P48163 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ME1P48163 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms