Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PIK3CBP42338 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms