Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1BP36896 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms