Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PPIFP30405 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PPIFP30405 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PPIFP30405 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PPIFP30405 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PPIFP30405 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PPIFP30405 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PPIFP30405 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PPIFP30405 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PPIFP30405 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PPIFP30405 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PPIFP30405 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PPIFP30405 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PPIFP30405 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PPIFP30405 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms