Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCAP28676 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCAP28676 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCAP28676 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCAP28676 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCAP28676 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GCAP28676 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
GCAP28676 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GCAP28676 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GCAP28676 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCAP28676 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCAP28676 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCAP28676 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCAP28676 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCAP28676 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCAP28676 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCAP28676 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCAP28676 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCAP28676 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCAP28676 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCAP28676 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCAP28676 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GCAP28676 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GCAP28676 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCAP28676 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCAP28676 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCAP28676 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCAP28676 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCAP28676 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GCAP28676 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCAP28676 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCAP28676 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCAP28676 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GCAP28676 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCAP28676 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCAP28676 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCAP28676 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GCAP28676 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCAP28676 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GCAP28676 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCAP28676 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCAP28676 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCAP28676 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms