Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD1P28340 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD1P28340 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD1P28340 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD1P28340 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD1P28340 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD1P28340 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD1P28340 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD1P28340 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD1P28340 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD1P28340 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD1P28340 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD1P28340 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD1P28340 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD1P28340 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD1P28340 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD1P28340 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD1P28340 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD1P28340 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD1P28340 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD1P28340 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD1P28340 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLD1P28340 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
POLD1P28340 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
POLD1P28340 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
POLD1P28340 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
POLD1P28340 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
POLD1P28340 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
POLD1P28340 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD1P28340 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD1P28340 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD1P28340 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD1P28340 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD1P28340 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD1P28340 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD1P28340 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD1P28340 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD1P28340 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD1P28340 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD1P28340 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD1P28340 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD1P28340 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD1P28340 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD1P28340 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD1P28340 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD1P28340 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD1P28340 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD1P28340 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLD1P28340 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD1P28340 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD1P28340 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD1P28340 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD1P28340 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD1P28340 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD1P28340 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD1P28340 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD1P28340 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD1P28340 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD1P28340 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD1P28340 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD1P28340 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD1P28340 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD1P28340 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD1P28340 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD1P28340 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD1P28340 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD1P28340 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD1P28340 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD1P28340 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD1P28340 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD1P28340 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD1P28340 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD1P28340 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms