Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms