Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms