Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms