Protein–RNA interactions for Protein: P25103

TACR1, Substance-P receptor, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TACR1P25103 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TACR1P25103 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TACR1P25103 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TACR1P25103 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TACR1P25103 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TACR1P25103 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TACR1P25103 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TACR1P25103 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TACR1P25103 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TACR1P25103 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TACR1P25103 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TACR1P25103 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TACR1P25103 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TACR1P25103 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TACR1P25103 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TACR1P25103 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TACR1P25103 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TACR1P25103 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TACR1P25103 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TACR1P25103 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TACR1P25103 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TACR1P25103 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TACR1P25103 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR1P25103 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR1P25103 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR1P25103 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR1P25103 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR1P25103 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR1P25103 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR1P25103 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR1P25103 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR1P25103 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms