Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APCP25054 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APCP25054 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APCP25054 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APCP25054 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
APCP25054 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APCP25054 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APCP25054 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
APCP25054 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APCP25054 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APCP25054 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APCP25054 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APCP25054 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APCP25054 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APCP25054 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APCP25054 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
APCP25054 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APCP25054 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APCP25054 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APCP25054 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APCP25054 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APCP25054 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APCP25054 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APCP25054 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APCP25054 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
APCP25054 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APCP25054 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APCP25054 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APCP25054 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APCP25054 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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APCP25054 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APCP25054 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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APCP25054 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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