Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CCL3L1P16619 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCL3L1P16619 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CCL3L1P16619 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CCL3L1P16619 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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