Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms