Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL2P13500 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL2P13500 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL2P13500 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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