Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMDP11532 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMDP11532 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMDP11532 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMDP11532 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMDP11532 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMDP11532 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMDP11532 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMDP11532 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMDP11532 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMDP11532 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMDP11532 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMDP11532 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMDP11532 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMDP11532 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMDP11532 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMDP11532 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DMDP11532 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMDP11532 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DMDP11532 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DMDP11532 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMDP11532 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DMDP11532 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMDP11532 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMDP11532 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMDP11532 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMDP11532 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMDP11532 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMDP11532 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMDP11532 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMDP11532 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMDP11532 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMDP11532 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DMDP11532 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DMDP11532 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DMDP11532 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DMDP11532 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DMDP11532 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DMDP11532 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DMDP11532 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DMDP11532 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DMDP11532 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DMDP11532 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DMDP11532 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DMDP11532 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DMDP11532 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DMDP11532 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DMDP11532 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DMDP11532 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DMDP11532 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DMDP11532 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DMDP11532 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DMDP11532 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DMDP11532 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DMDP11532 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DMDP11532 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DMDP11532 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DMDP11532 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DMDP11532 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DMDP11532 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DMDP11532 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms