Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms