Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms