Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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PTPRCP08575 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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PTPRCP08575 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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PTPRCP08575 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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PTPRCP08575 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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PTPRCP08575 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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PTPRCP08575 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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PTPRCP08575 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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PTPRCP08575 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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PTPRCP08575 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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PTPRCP08575 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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