Protein–RNA interactions for Protein: P04118

CLPS, Colipase, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSP04118 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPSP04118 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPSP04118 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPSP04118 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPSP04118 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPSP04118 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPSP04118 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPSP04118 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPSP04118 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPSP04118 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPSP04118 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSP04118 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSP04118 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms