Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERPINC1P01008 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms