Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRMUO75648 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRMUO75648 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRMUO75648 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms