Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
JRKO75564 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
JRKO75564 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
JRKO75564 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
JRKO75564 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
JRKO75564 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
JRKO75564 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
JRKO75564 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
JRKO75564 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
JRKO75564 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
JRKO75564 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
JRKO75564 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
JRKO75564 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
JRKO75564 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JRKO75564 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JRKO75564 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms