Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXTL3O43909 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms