Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

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Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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