Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRTO14522 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms