Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F3O00716 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F3O00716 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms