Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms