Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1D1 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1D1 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1D1 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1D1 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1D1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1D1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1D1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1D1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1D1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1D1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1D1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1D1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1D1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1D1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1D1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1D1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1D1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1D1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1D1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1D1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1D1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1D1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1D1 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1D1 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1D1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1D1 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1D1 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1D1 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1D1 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1D1 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1D1 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1D1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1D1 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1D1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1D1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1D1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1D1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1D1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1D1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1D1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1D1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1D1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1D1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1D1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
H7C1D1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
H7C1D1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1D1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms