Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GOLGA8SH3BPF8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA8SH3BPF8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms