Protein–RNA interactions for Protein: F8WFD2

NPIPA3, Nuclear pore complex-interacting protein family member A3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA3F8WFD2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms