Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms