Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms